东南亚已经成为许多生物工程技术公司的庇护之地，在摩加迪休（索马里首都），一种高传染性病菌从研究中心扩散到人群，病毒迅速入侵人体并致人于狂躁，犹如僵尸般生吃未受感染的人，城市陷入了毁灭的境地，雇佣兵迈克尔｀加特林受雇前往营救雇主的女儿，不断受到感染人群的死亡攻击，营救任务充满死亡气息⋯⋯
2009年，当麻纱绫（户田惠梨香饰）和濑文焚流（加濑亮饰）相识的前一年。在美国FBI学成归来的当麻被分在警视厅公安部公安第五课未详事件特别对策系，接受组长野野村光太郎的直接领导。此前不久，某大型石油企业高管接连被人杀害，死者的心脏无一例外都留下被人用手捏过的痕迹。显而易见，这一系列事件和所谓的SPEC持有者有着极为密切的联系。与此同时，石油企业高管Diablo（大杉涟饰）高薪聘请神秘SPEC持有者一十一（神木隆之介饰），企图阻挡神秘的SPEC杀手。一十一，这个日后与当麻和濑文有着不解渊源的难缠敌手将当麻视作杀害父母的爆弹女，之后更斩杀了当麻在美国结识的好友Nancy。 SPEC宏大篇章自此拉开序幕，决定世界命运的重大事件也进入了倒计时……
In1929,anexpeditionofuniversitybotanistsenteranunchartedforestwheretheydiscover,andmustescapeanancientorganism.
一位善良的拾荒老人马老汉，在路上偶遇昏迷在路边的遇难男孩，便将他带回家中收养。男孩是马老汉收养的第三十六名孤儿，即取名马三十六。一天大雨，马三十六因一个意外，不慎被雷电击中，昏迷中，马三十六找回了他消失的记忆，原来自己是快乐星球被研发出来的唯一的类机器人。Q博士摧毁了快乐星球，自己是唯一逃脱的幸存者，Q博士一直在寻找他，想要把他彻底除掉。同时，Q博士又试图主宰地球。马三十六为了拯救快乐星球，保护地球人，与Q博士开始了一段勇气与智慧并存的战斗......
地球被核战争摧毁之后，地球最后的人类派出多艘侦察飞船，在宇宙中寻找一个宜居行星，以拯救人类，而飞马座号是其中的一艘飞船，在历经磨难之后，终于发现了一颗宜居行星，可是，它已经被中国人占领了…
