2010年，曾经的小学生们已经步入大学，太一、阿和等人步上不同的人生道路（八神太一和石田大和将会成长为22岁），而就在此时，数码宝贝的研究者メノア(松冈茉优配音)却告诉他们：“被选召的孩子们”长大成人后，数码宝贝也将随之消失…。预告中字幕表明这是“太一他们最后的故事”，结尾则注明：献给所有和数码宝贝一起成长的“孩子”们，还有亚古兽注视着长大成人的太一的背影，“太一，你长大了呢”。
炎热的夏天过去，枝上的树叶慢慢转成红色。中央公园内，松鼠、浣熊们发现过冬的坚果根本不够用，这群小动物可能面临一场前所未有的饥荒。松鼠塞利（威尔·阿奈特WillArnett配音）和安迪（凯瑟琳·海格尔KatherineHeigl配音）奉命前去寻找坚果，它们计划打劫一辆坚果车，谁知却造成了一场大混乱，还导致好不容易的手的坚果毁于大火。在此之后，塞利遭到流放，只有他的老鼠朋友巴蒂（RobertTinkler配音）自始至终跟着他。另一方面，安迪则和自我感觉良好的同伴格里森踏上寻找坚果的征途。最终，安迪和塞利在一座库藏丰富的坚果店重逢，而那里的幕后老板竟然是一个臭名昭著、穷凶极恶的罪犯。 螳螂捕蝉，黄雀在后，犯罪分子策划新的劫案同时，却不知有一群小动物正准备打劫他们……
为了拯救她的兄弟姐妹，一位年轻女子承担了她的父亲和强大的实体，被称为游戏大师，谁把人类的恶魔阴谋，而她的物种赌博的结果。
