一只古老的巨怪在挪威的山中苏醒后，乌合之众的一班英雄必须团结一心，努力阻止巨怪造成致命浩劫。
玲珑山庄主十三燕早已退出江湖，李少白和狄八方却在其房里发现命案物证，然而十三燕中毒多年已成废人，少白查出十三燕好友屈方才是真凶。屈方听令于夜叉组织，下毒抢劫继而栽赃十三燕。
墨龙鼎，一个看似普通得不能再普通的香炉！数十年，却不断有人因它丧命！ 李少白决定探寻有关福王宝藏的秘密，带着墨龙鼎赶往阴山，却成为众多盗墓者眼中的猎物。吐蕃郡主含笑的魅惑，让李少白误食毒药，幸得菱儿相救才化险为夷。 阴山龙吟寺闹鬼，李少白拜访寺内主持不悔大师，多次遭拒。之后又遭神秘人偷袭，墨龙鼎被毁。而菱儿又被女鬼抓去，危在旦夕。 李少白再次拜访不悔，含笑正带人围攻龙吟寺，向不悔寻仇。危机时菱儿带女鬼出现，才知那女鬼就是含笑的生母，而不悔竟是含笑的父亲，墨龙鼎真正的传人——墨龙之子墨青！
洛阳花会期间三名武林名士神秘死亡，李少白前去查案。之后查出“牡丹使者”与嵇善德为争名向各派弟子下毒手，李少白等人将嵇善德杀死后发现背后仍然有夜叉组织的黑手。
开封府师爷张光禄、捕快徐三脚接连被杀，疑犯韩武却宁死不肯认罪，在狱中自杀。 李少白和狄八方到张光禄家中调查，发现张光禄办公的书房已被人烧毁。 神偷龙九总爱查人隐私，在揭穿张光禄妻子和韩武的奸情时，提供了重要线索。与李少白、狄八方二人喝酒时又将玩笑开到了知府大人头上，告诉二人，开封知府孙耀祖和戏班女子绣娘也有奸情。 李少白怀疑张光禄之死和官府账目有关，到库房查账，遭人偷袭，随后立刻带人去戏班抓捕绣娘。 原来，表面清廉的开封知府孙耀祖一直假造账目私吞公款，加入夜叉组织，意图谋反。而一直帮其造假的师爷张光禄记下了两人所有的账目，并借此要挟。孙耀祖让绣娘杀掉张、徐二人，又计划铲除李少白和狄八方。没想到李少白在他之前找到了线索，那本关系着几条人命的账本就藏在张光禄的鸟笼子里。
北宋晚期，朝廷内忧外困，武林动荡，夜叉门趁机作乱。京都聚义钱庄遭人洗劫，掌柜钱无用在密室中被杀人焚尸，凶手疑于少林有关。少林顽逆弟子李少白奉命助官府办案，却与开封总捕狄八方不和，冲突不断。 另一方面又有人接连遇害。李少白察觉凶手的本意并非谋财，而真凶仍在钱庄之中。
大理寺侍郎顾天凌请少白到将军府暗查其到底有无谋反。少白却意外发现将军二夫人就是之前的绣娘。而本是男人的绣娘竟是夜叉组织大护法笑无常。最终笑无常轻松脱逃，离去前警告少白，将有更多人因他而死。
太子赶往惠王府吊丧，遭人袭击，刺客使用的兵器正是公输宏死前复原的诸葛连弩。夜叉势力已经扩展到王宫，危及皇权。顾天凌深夜请李少白入宫。太子携百官听慧仁方丈普法讲佛，夜叉再次派人行刺。幸好齐王出手相救，假扮太子的李少白才逃过一劫。太子设宴感谢齐王，却在宫殿设置机关，将齐王囚困。李少白解析案情，指出齐王才是夜叉组织的真正头目——大夜叉，但他却没想到齐王就是自己的亲生父亲。
开封城内，许多孩子神秘失踪，案情与大兴赌坊有关。李少白到赌坊调查，发现赌坊老板韩天佑独子韩星儿也被人掳走。韩天佑是名震江湖的千佛手，而他最大的敌人就是二十年前败在自己手下的赌王玉面罗刹诸葛卿……
白马镖局总镖头白啸天小女出嫁，武林各派前往贺喜，李少白代表少林出席。宴会间突发惨案，多位武林人士遭到暗杀组织黑鹰帮偷袭，新娘子也在闺房惨死。
故事讲述了上古神魔大战后，神王用炼妖炉、天晶剑、神农尺封印魔神破天，将其囚禁于炼狱枯井，将三神器分别传于墨月族、玄武族、和修仙院分别掌管，并交代三族之长神器不可共同出世，千年后，神王陨落，玄武一族不顾祖训，为了更强大的实力发动战争夺取神器，实力相对弱小的墨月族惨遭屠戮，族长不得不派墨月大将姜成前往神秘禁地聚灵神殿求援，修仙学院作为看守炼狱之井的神秘组织，为阻止神器聚合第一次公开示人，墨月族长担心玄武一族卷土重来，派姜成拜入修仙院，在同袍的捉弄中努力修行姜成得到了突飞猛进的成长，随着修仙院的掌门被害，一个天大的阴谋开始浮出水面，生死存亡之际，姜成带领师兄弟一起对抗魔族奸细，最终阻止了魔神降世。
官子萱作为海洋生物研究学家，在一次对短头鲵研究的过程中，短头鲵发生变异并逃走。而在此之前，官子萱的父亲因为调研大鲵也消失了，官子萱为了找到这个变异大鲵找到父亲，决定启程深海，前往荒岛。
